ABOUT THIS RECORDspecies: Arabidopsis thaliana
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTATCATCATCATCCTCGTAA miRNA* AGGAGGTGGAGGTGGAGGAG mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GATTCTCTTTCTCTCTATCTATCATCATCATCCTCGTAATCCTCTCCTTTCTCCTTCAGACCCCTCCTAGTTGCTGTTTAAACAAACAAAAAAAGACTGC
TTCTCTTTCTTATTTCTCTCATCATCATCATCAATGGTTTTATGAGATTTATATCAAAAAACATTGAGGAGCTAGAGAGAAAGAGAGAGTGTGTGTGTAG
AAAAAGATTGAAACATCATCAAGATTGATGGAGCAAGGAGGAGGTGGTGGTGGTAATGAAGTTGTGGAGGAAGCTTCACCTATTAGTTCAAGACCTCCTG
CTAACAACTTAGAAGAGCTTATGAGATTCTCAGCCGCCGCGGATGACGGTGGATTAGGAGGTGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGNAGGAANT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|Q9C882|GTL1_ARATH: 0.00000000003 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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