ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR2123
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAAAAAATCAACGGTGTCATA miRNA* TAACACTATTGATTTTTTTTG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CGAAGTGAGTACTACCTCCGTTCATAAATATATAACACTATTGATTTTTTTTGAAAACTTTGACCACTCGTTTTATTCAAAATATTTATTCTAAAATGTA
AAATTTTAAGTCAAGCACAAACTAAATCATATAAAAATAAATGATAACTCATTATTTTTTTAATAAAACGAGTGATTAAATTTTTTTTAAAAAAATCAAC
GGTGTCATATATTTACGAACGGGGAGCACTTACCATTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR818e: 0.0000008 PMRD osa-miR818e: 0.0000008 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR812: 0.0000009 | most similar mature miRNAs |
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