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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003832
species: Oryza sativa
miRNA family: MIRf905
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 CCCTATCACATCGGATGCTGA

miRNA*
 AGTGTCTAAAGACAGGGAC

mismatches: 4
bulges: 2
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pre-miRNA
 GGCCTGTTAGATGGGACTAAAACTTTTAAGTCCCTATCACATCGGATGCTGAAAATTATTATAAATATTAAACGTAGACTATTAATAAAACCCATCCATA
ATCTTGGACTAATTTGCGAGACGAATCTAATGAGCCTAATTAATCCATAATTAACCTATGTGATGTTACAGTAAACATTCTCTAATTATAGATTAATTAG
GCTTAAAAAATTTATCTCGTGAATTAGCTTTTATTTATGTAATTGTTTTGTAAGTAGTCTATATTTAATACTCTAAATTAGTGTCTAAAGACAGGGACTA
AAGTTAAGTCCCTGGATCTAAACACC

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR445d: 2e-32

PMRD osa-miR445d: 2e-32

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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