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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003842
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR1875
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ACAATGGAGTGAAGTGCAACAGAA

miRNA*
 TCATTGCACTGTGCTCCATTGTGG

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 GCAGTTTAGTATGGTTTTGCTTTGCCACTGTGCTGTCCATTTTCATTGCACTGTGCTCCATTGTGGTATTGACATTCTGCAAGAACGAGTCCCAGTATCA
AGTCACTGTTACGGTGTTGTTGGTACCATTGATTAACAACACTTGACGGCCATACTTGGTCATGTTGTATGTTATCAGCTTCACAGAGGTACATGTGGCA
CTTTAACAGTTATTTGATACAGTGACTAGGCTGCAGTTGAGCGAAACCACAATGGAGTGAAGTGCAACAGAAATGAACATTATGGCAGCAAAGTGAAAGT
TTGTCAAACTGCCGGGGA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR1875: 3e-133

PMRD osa-miR1875: 3e-133

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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