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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003862
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TTGACCAAATTTATAGAAAAA

miRNA*
TTTTTATAAACTTGATCAAAT

mismatches: 3
bulges: 0

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pre-miRNA
GTTTGATAGTCTACCTCCTCTGTTATAATATAAGTCGTTTTGACTTTTTTCTTAGCTAAGCTTTTATAAGTTTGACCAAATTTATAGAAAAATTAGCAAT
ATTTATAATATCAAATTAGTTTTATTAAACGAAACATTAAATATATTTTGATAATATATTTATTTTGTATTAAAAATGTTGCTAACTTTTTTATAAACTT
GATCAAAT
TCTAAAAAGTTTGACCAGAAAAAAGTCGAAGTGACTTATAATATGAAACAGATGGAATAGCTCTCTGT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase sbi-MIR437r: 0.0000009

PMRD sbi-miR437r: 0.0000009

microPC miR1435: 0.00001
UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.0003
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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