ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTAGGCTTAAAAGATTCGTCT miRNA* ACGAATTTATTAAGCCTAATT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAAACGTAGTGTAATAATAAAATTTTGCCTATAAACTGCGAGACGAATTTATTAAGCCTAATTAACTTGTCATTAGTAAATGTTTACGGTAGCACCACAT
TTTTTATCAAATAATGACGCAATTAGGCTTAAAAGATTCGTCTTGCAATTTACTGGCGAACTATGTAATTATTTTTTTCTAC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124e: 5e-29 PMRD osa-miR442: 2e-28 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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