ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTACATTGTGAAACGGAGGAA miRNA* CCTCCGTTTCACAATGTAAGT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTGTGATGTACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTTTAGCATTTTCCACATTTATATTGTTGTTATTGAATCTAGACATATATATTTATCTAGATTC
ATTAACATCAATATGAATATAGAAAATACTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTACCGTATA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR808: 4e-54 PMRD osa-miR808: 4e-54 microPC miR809: 2e-22 | UniProt sp|Q6K1U0|P2C17_ORYSJ: 0.0003 RFAM MIR1122: 2e-59 | most similar mature miRNAs |
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