ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf259
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGCTGGTGGTGCTCCTGCAGC miRNA* TGCTGGTTACTTCACTGGTGAA mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
NCTGCCGGTGGTGCTGGTGGTGCTCCTGCAGCTGAGGCGAAGAAAGAAGATAAGGTCGAAGAGAAGGAAGAAAGTGATGATGACATGGGCTTCAGTTTGT
TTGACTGAGTGATGCGGTCNCCTCTTNTATCATCAATACCAGACTTTGCGCAGGAAACTANAGTGATGATGTTTGGGATTTTAGCTTTTNTTCTTTAGTT
AAGTTGAAAACNCTTGAGGAAAGACTATGCTTCCTACTATGTTTTGATATGTAGTAACNCAGCCATAGGTTGCTGGTTACTTCACTGGTGAACCATGCTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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