ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTAAGTCATTCTAGCATTT miRNA* ATGCTAAAATGCACTAACCATTG mismatches: 2 bulges: 2 |
pre-miRNA
ATATACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCATATTTATATTGATGTTAATGAATCTAAACATATATATTTATCCTAGATCCATTA
ATATTAATATGACTGTGGGCAAATGCTAAAATGCACTAACCATTGGTGAAACCAGAGGGTAGT
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR809d: 4e-29 PMRD osa-miR809d: 4e-29 microPC miR809: 1e-20 | UniProt sp|Q6K1U0|P2C17_ORYSJ: 0.00002 RFAM MIR1122: 4e-42 | most similar mature miRNAs |
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