ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf1334
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTCCGTCAGCCTTGATCGCT miRNA* CGATCAAGGCGGACGGAAAAT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCAAAGTTCACTCTGTTCCCATTTTTAACACTTCCGTCAATTCTTGATTGTTTTCCGTCAGCCTTGATCGCTATTGACCTGCCACACACGCGATATGACG
TTTCTACTCCTCATAAGCACAAGTAGAATGCATGGCAATAAGGGGGTAGAAACATCATGCTGTGTGCGTGGCTGGGTCAATAGCGATCAAGGCGGACGGA
AAATGCTCAAGAATTGACGGAAGTGTTAAAAATGGGAACAGA
dot-bracket secondary structure
...........((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.(
(((((((((((.....((.((.((.....)).)))).....)))))))))))).))))).)))))).))))).)))))))))))))))))))).))))))
))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
CCAAAGTTCACTCTGTTCCCATTTTTAACACTTCCGTCAATTCTTGATTGTTTTCCGTCAGCCTTGATCGCTATTGACCTGCCACACACGCGATATGACG
TTTCTACTCCTCATAAGCACAAGTAGAATGCATGGCAATAAGGGGGTAGAAACATCATGCTGTGTGCGTGGCTGGGTCAATAGCGATCAAGGCGGACGGA
AAATGCTCAAGAATTGACGGAAGTGTTAAAAATGGGAACAGA
dot-bracket secondary structure
...........((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.(
(((((((((((.....((.((.((.....)).)))).....)))))))))))).))))).)))))).))))).)))))))))))))))))))).))))))
))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf11843-akr: 0.00000000005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
