miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Back to search results



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003963
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR806
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATGTGCTAAAAAGTTAACGGT

miRNA*
TGGTTAACTTTTTTTAAATATGT

mismatches: 3
bulges: 2

View larger
pre-miRNA
TACGGGAATTGAATACTCCATCCGTTTCTAAATATTTAACGCTGGTTAACTTTTTTTAAATATGTTTGGCAGTTCATCTTATTAAAAAAATTTAAGTAAT
TATTAATTCTTTTCATATCATGTGATTCATTGAGAAAATACTTAAATGTATACATATAGTTTTACATATTTCACAAAAGTTTTTGAATAAGACGAATGTC
AAACATGTGCTAAAAAGTTAACGGTGTCGAATATTTAGAAACAGAGGGAGTATATAGCTCTCTT


dot-bracket secondary structure
...((((.(((.(((((((.((.((((((((((((((.((((((.((((((((((....((((((((((((.(((.(((((((..(((((((((((((.(
(.(((((.....((((.....))))...)))))..)).)))))))(((((.((.....))..))))).(((...))).)))))).))))))).)))))))
))))))))...)))))))))))))))).)))))))))))))).)).))))))).))).))))..



SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806h: 2e-44

PMRD osa-miR806h: 2e-44

microPC miR806: 2e-26
UniProt no hits

RFAM MIR806: 2e-57
most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record





Liczniki na strone;