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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST003963
species:
Oryza sativa
miRNA family:
MIR806
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa
Oryza
Oryzeae
Ehrhartoideae
BEP clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATGTGCTAAAAAGTTAACGGT
miRNA*
TGGTTAACTTTTTTTAAATATGT
mismatches:
3
bulges:
2
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pre-miRNA
TACGGGAATTGAATACTCCATCCGTTTCTAAATATTTAACGC
TGGTTAACTTTTTTTAAATATGT
TTGGCAGTTCATCTTATTAAAAAAATTTAAGTAAT
TATTAATTCTTTTCATATCATGTGATTCATTGAGAAAATACTTAAATGTATACATATAGTTTTACATATTTCACAAAAGTTTTTGAATAAGACGAATGTC
AAAC
ATGTGCTAAAAAGTTAACGGT
GTCGAATATTTAGAAACAGAGGGAGTATATAGCTCTCTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
osa-MIR806h
:
2e-44
PMRD
osa-miR806h
:
2e-44
microPC
miR806
:
2e-26
UniProt
no hits
RFAM
MIR806: 2e-57
most similar mature miRNAs
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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