ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTACGTTGTGAAACGGAGGAA miRNA* CCTCCGTTTCACAATGTAGTC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTGTATTGTACTTCCTCCGTTTCACAATGTAGTCATTCTAGTATTTCCCACATTCATATTGATGTTAATGAATCTAGATAGATATATATGCCTAGATTCA
TTAACATTAATATGAATGTGGAAAATGCTAGAATGACTTACGTTGTGAAACGGAGGAAGTACTTTTTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR809d: 6e-56 PMRD osa-miR809d: 6e-56 microPC miR809: 3e-30 | UniProt sp|Q6K1U0|P2C17_ORYSJ: 0.00003 RFAM MIR1122: 2e-59 | most similar mature miRNAs |
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