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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004749
species: Oryza sativa
miRNA family: MIRf89
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 CTATCTTTAGTCCCGGGTGAA

miRNA*
 TAACCGGGACTAAAGATAGCG

mismatches: 5
bulges: 0
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pre-miRNA
 GTAGGCCTTCCAGGCCAGTCGAGACGACGCGACCTGCGAGTGGAGCATCAAGAAATCGAACGTCAGTTACAAGAGATGCAGCAACTGGAACGCGAGCGTC
AGCAACTGGAGCAACAAGAAATCGAACGTCAGTTACCCTCGCGTCAGCAACTGGAGCAACAAGAAATCAAACGTCAGTTACAAGACATGGAACGCGAGCG
TCAGCTACACCGGTGGAGAAACTTTGTAACCGGTGGAGAAACTTTGTAACCCCCCTTTAGTCCCGGTTTCCAAACCGGGACTACCAATCCGGGACTAAAG
ATCGCTATCTTTAGTCCCGGGTGAAATAACCGGGACTAAAGATAGCGATCTTTAGTCCCGGATTGGTAGTCCCGGTTTGGAAACCGGGACTAAAGGGGGG
TTACAAAGTTTCTCCACCGGTTACAAAGTTTCTCCACCGGTGTAGCTGACGCTCGCGTTCCATGTCTTGTAACTGACGTTTGATTTCTTGTTGCTCCAGT
TGCTGACGCGAGGGTAACTGACGTTCGATTTCTTGTTGCTCCAGTTGCTGACGCTCGCGTTCCAGTTGCTGCATCTCTTGTAACTGACGTTCGATTTCTT
GATGCTCCACTCGCAGGTCGCGTCGTCTCGACTGGCCTGGAAGGCCTA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD osa-miRf11822-akr: 2e-31

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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