ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIRf380
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGCGCCGACGATGACGGAGGA miRNA* CTTCAGTCCATGTCAGTGTCCT mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
AGGGAGTTGATGGCGCCGACGATGACGGAGGAGAACCATACGGCGACGATGGCGCCGCCGGCGTACGTCAGCACGGTGGACTTGTTCTCGACGGCGTCCC
ACTTGGCTTTCAGGTCGTCGACGAGCTCGTCGCCGCTCGCGGCAGAGGTGTCATCGGAGGAGGCCTTCGCCCGGAGCAGAGAGAGCCGCGGTGTATCTTG
GAGGCCAAGAGGGGAGAAGTTACGCCGTGGGAGGAGAACGGACCGCGGCGCGGCGGCGGCGCGGACGGGGAGGCGCGCTCCTGCTCCACCCAGAAGCGCC
GTAGAGCACGCCGTTGTGGCCATGTTCTCACCTGCAAGCTCTTTCTACTCCTTCAGTCCATGTCAGTGTCCTCGTGCTCC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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ACTTGGCTTTCAGGTCGTCGACGAGCTCGTCGCCGCTCGCGGCAGAGGTGTCATCGGAGGAGGCCTTCGCCCGGAGCAGAGAGAGCCGCGGTGTATCTTG
GAGGCCAAGAGGGGAGAAGTTACGCCGTGGGAGGAGAACGGACCGCGGCGCGGCGGCGGCGCGGACGGGGAGGCGCGCTCCTGCTCCACCCAGAAGCGCC
GTAGAGCACGCCGTTGTGGCCATGTTCTCACCTGCAAGCTCTTTCTACTCCTTCAGTCCATGTCAGTGTCCTCGTGCTCC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|O04616|Y4115_ARATH: 0.000000000002 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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