ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: miR166g
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGATGTTGTTTGGCTCGACA miRNA* TCGGACCAGGCTTCATTCCTC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
ATTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGA
ATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTTC
dot-bracket secondary structure
.....(((.((((.((((((((((((((..((((((.(((((....((((((((((...(((((((((((((((((.(((((........))))).))))
))))).))))))))(((.....)))...))))))))))....))))).))))))..))))))))))))))..)))).)))...
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
ATTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGA
ATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTTC
dot-bracket secondary structure
.....(((.((((.((((((((((((((..((((((.(((((....((((((((((...(((((((((((((((((.(((((........))))).))))
))))).))))))))(((.....)))...))))))))))....))))).))))))..))))))))))))))..)))).)))...
SIMILARITIES| miRBase zma-MIR166m: 0.00000001 PMRD zma-miR166m: 0.00000001 microPC miR166: 0.0001 | UniProt no hits RFAM mir-166: 0.0000002 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
