ABOUT THIS RECORDspecies: Ixodes scapularis
miRNA family: miR-2163
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ixodes scapularis Ixodes Ixodinae Ixodidae Ixodoidea Ixodida Parasitiformes Acari Arachnida Chelicerata Arthropoda Panarthropoda Protostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGCATAGTCTATTAATTTCC miRNA* AGTCTAAGACTATGCAGCA mismatches: 2 bulges: 2 |
pre-miRNA
CTGGAGGTGGGTTGCATAGTCTATTAATTTCCGACCTTTGCATAGTTTTTCTTTTATAGCTAACGAATTGAGGTTGAACAAAATCTGGTAGATATCTATG
TATGTGGGAACTGGGTCATTGGTGCATAGAACAGTACGGGCTGGGGCTTCATTTTGTCAGAAACTAAAGTTGAAGTTGGAGTCTAAGACTATGCAGCAAC
ACAAGA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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HuntMi prediction: not a miRNA
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