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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST008446
species:
Sorghum bicolor
miRNA family:
MIRf10
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor
Sorghum
Andropogoneae
Panicoideae
PACCAD clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TTTAAAAGATTCGTCTCGCAA
miRNA*
GCGAGACGATTTTTTAAATT
mismatches:
0
bulges:
1
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pre-miRNA
TTAGCTACTATAGTATTTTTGTTTTATTTAGTAATTAATATTCACTCGTAGATTAATTAAG
TTTAAAAGATTCGTCTCGCAA
TTTACAGACAAACTGTGT
AATTAGTTTTTTTGTCTAATATTTAATGTTCCGTGCACATGTCCAAAGATTTGATATGATGGATAAAAATATTTTGAGTGTGGAACTAACAAGGCATAAC
AATTACCAATGTGTCCATGATTGGAAAACTCACACAGTAGTACTTCGAGCCTGTTCGTTTTTCTTTTCGGCCGTACTTTTTCTGTTAGCTATGAGTGTTT
TTCTCTTACAATAAATTAGTCAATAGTAATTCAAACCAGCGAACAGTAAGTGTAGTGAACCTTAGTGCATCCTAAAACAGTGTGTACAAATCGATAATAT
TTGGATACATGTATAAAGTATTAAATGTACACTACTTACAAAACTAAAAACATAGATAGAGAATAATTT
GCGAGACGATTTTTTAAATT
TAATTAGTCTA
TGGTTAAACACTAATTGATGTAATTACAAATCCTATAGTATGTATTA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
osa-MIR2124h
:
0.00000003
PMRD
osa-miR442
:
0.0000005
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
most similar mature miRNAs
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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