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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST008516
species:
Chlamydomonas reinhardtii
miRNA family:
MIRf1575
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii
Chlamydomonas
Chlamydomonadaceae
Chlamydomonadales
Chlorophyceae
Chlorophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATGCCATGCCTGTCTAGCTAT
miRNA*
AGCAGACAATGTGGCGACA
mismatches:
3
bulges:
2
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pre-miRNA
GGGCCCCCCCCT
AGCAGACAATGTGGCGACA
GGAAAGCATAGTGCTTGGGCCTCTTCTATGCCCTTGGCACCCAGATGCAGGTGGATGCACTAGCGCCCA
CGACTAGCGCCCCGTGGACCGTATTGCAGGTCGCAACCTACCCCTGTGGCCTACCCCTCCCTCGTGAATTTACCGTTGATACGCCGCTTTATACTACCAT
GGCCGTAGCACGGGGAACAACCCGCATCATCCGTGACACGTGTATGTACATACCTGCCTTGTTACGTCAGGCTCTTCGTCTTATCACAAAGATTACTGTA
GTCGCTCACGCACCTTCGAAACATTGAACACTGCACAGACGTCTATCTTATTGTCAGCACCACCAAGCACGCTGTATGCAGTATTCTTCATGCAACCTGC
ATGCGCCTTGTTGTGCAGCTCCGATTGCTGGGGGGTTCGCACCGCTGTGCCTGTACGTACAGGCGTACAGCCACACGGGTCCCGAACTCCCTACGTTGCC
TAGCGCATAAGACGCCTTATACCTGTATGGCGTCCTACCAAGTGACAAGGTCACCCGCCTGGCTGCGTGGCCTGCTGGTGGGATCCAGGCGATGTCTCCA
CA
ATGCCATGCCTGTCTAGCTAT
GGGTTGTGC
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction:
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