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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008516
species: Chlamydomonas reinhardtii
miRNA family: MIRf1575
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas Chlamydomonadaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATGCCATGCCTGTCTAGCTAT

miRNA*
AGCAGACAATGTGGCGACA

mismatches: 3
bulges: 2

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pre-miRNA
GGGCCCCCCCCTAGCAGACAATGTGGCGACAGGAAAGCATAGTGCTTGGGCCTCTTCTATGCCCTTGGCACCCAGATGCAGGTGGATGCACTAGCGCCCA
CGACTAGCGCCCCGTGGACCGTATTGCAGGTCGCAACCTACCCCTGTGGCCTACCCCTCCCTCGTGAATTTACCGTTGATACGCCGCTTTATACTACCAT
GGCCGTAGCACGGGGAACAACCCGCATCATCCGTGACACGTGTATGTACATACCTGCCTTGTTACGTCAGGCTCTTCGTCTTATCACAAAGATTACTGTA
GTCGCTCACGCACCTTCGAAACATTGAACACTGCACAGACGTCTATCTTATTGTCAGCACCACCAAGCACGCTGTATGCAGTATTCTTCATGCAACCTGC
ATGCGCCTTGTTGTGCAGCTCCGATTGCTGGGGGGTTCGCACCGCTGTGCCTGTACGTACAGGCGTACAGCCACACGGGTCCCGAACTCCCTACGTTGCC
TAGCGCATAAGACGCCTTATACCTGTATGGCGTCCTACCAAGTGACAAGGTCACCCGCCTGGCTGCGTGGCCTGCTGGTGGGATCCAGGCGATGTCTCCA
CAATGCCATGCCTGTCTAGCTATGGGTTGTGC


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
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