ABOUT THIS RECORDspecies: Chlamydomonas reinhardtii
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas Chlamydomonadaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACATCGCCATCATCATCATCG miRNA* GTGGTGATGATGGTGCTCTGG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGCTTAGCGGCGGCACATGGAGTCGCGCACGAGCTGGATGTGCGACAAAGAGCTGTGTCCAACATCGCCATCATCATCATCGAAGGCGCCGGGCGCTTTC
TCAAGGCGTCGGGGCATGCCAGTCAGGCGAAAGCTTGGGTGGTGGTGATGATGGTGCTCTGGGGCAGTGAGTCGTGCATGCAGATGTATGTGAGGCGGCT
TCATGCGTGTGTCGCGCCCG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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GGCTTAGCGGCGGCACATGGAGTCGCGCACGAGCTGGATGTGCGACAAAGAGCTGTGTCCAACATCGCCATCATCATCATCGAAGGCGCCGGGCGCTTTC
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TCATGCGTGTGTCGCGCCCG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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