ABOUT THIS RECORDspecies: Chlamydomonas reinhardtii
miRNA family: miR1143
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas Chlamydomonadaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGGACGTCCCCTTACGGGAAT miRNA* ACCCGAAGGGGACGTCCTTC mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTAAACTTAGCATGTTTACATACTCCGAAGGAGGACGTCCCCTTACGGGAATATAAATATTAGTGGCAGTGGTACCGCCACTGCCTAGTATATAAATATC
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase cre-MIR1143: 2e-25 PMRD cre-miR1143: 2e-25 microPC no hits | UniProt sp|P37825|YCX5_CHLRE: 0.00008 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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