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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST046748
species: Oryza sativa
source: microPC, original name: miR806

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATGTGCTAAAAAGTCAATGGTG

miRNA*
CTATTGATCTTTTAACACATGT

mismatches: 3
bulges: 0

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pre-miRNA
TACTATTGATCTTTTAACACATGTTTGACCGTTCATCTTATTCAAAAACTTTTGTAAAATATGTAAAACTATACGTATGCATAAAAGTATATTTAACAAT
GAATCAAATTATAGGAAAAAAAATAATAATTATTTAAATTTTTTGAATAAGACGAGCGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAATGGTG


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806h: 1e-41

PMRD osa-miR806h: 1e-41

microPC miR806: 2e-43
UniProt no hits

RFAM MIR812: 5e-57

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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