ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGTGCTCC miRNA* AGCGTCCTTCAGTCCACTC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGCGTCCTTCAGTCCACTCATGGGCGGTGCTAGGGTCGAATTAGCTGCCGACTCATTCACCCACATGCCAAGCAAGAAACGCTTGAGATAGCGAAGCTT
AGCAGATGAGTGAATGAAGCGGGAGGTAACGTTCCGATCTCGCGCCGTCTTTGCTTGGACTGAAGGGTGCTCC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR319b: 3e-95 PMRD osa-miR319b: 3e-95 microPC miR319: 0.000000000009 | UniProt no hits RFAM MIR159: 5e-94 |
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