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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST048652
species:
Hordeum vulgare subsp. Vulgare
miRNA family:
MIR156
source:
PMRD, original name:
hvv-miR156a
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TGACAGAAGAGAGTGAGCAC
miRNA*
GCTCACCCTCTCTCTGTCT
mismatches:
2
bulges:
1
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pre-miRNA
TGACAGAAGAGAGTGAGCAC
ACAGCGGCAGGCTACGTCTGATAAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTGCTGGCTATAAGCATCTTTATAGCTCATCT
TATAGCTGGCTTGTACAATAGTTAGCTGTAAAAGAGTACTACTTTTATCATATATGGCCTACCTTTCATTCTCACAAAGCACCTATGAGCACGTGCTAGA
GCCGGCTCTTCACGAAGAGCCCGCTTCCCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTCAGCAAANATATAGTATTTTAATCCTTACAGCCTGCTGACTG
TACCTTATTGTACTTGCTCTAAAGAGGACGGATGGATGCGAAGAGAGAGAGAGATAGACGCAGCTGCTGTTGCGT
GCTCACCCTCTCTCTGTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
hvu-MIR156
:
2e-39
PMRD
osa-miR156f
:
0.00000002
microPC
miR156
:
0.000001
UniProt
no hits
RFAM
mir-156: 0.000002
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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