ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare subsp. Vulgare
miRNA family: MIR156
source: PMRD, original name: hvv-miR156a
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGTGAGCAC miRNA* GCTCACCCTCTCTCTGTCT mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGGCTACGTCTGATAAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTGCTGGCTATAAGCATCTTTATAGCTCATCT
TATAGCTGGCTTGTACAATAGTTAGCTGTAAAAGAGTACTACTTTTATCATATATGGCCTACCTTTCATTCTCACAAAGCACCTATGAGCACGTGCTAGA
GCCGGCTCTTCACGAAGAGCCCGCTTCCCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTCAGCAAANATATAGTATTTTAATCCTTACAGCCTGCTGACTG
TACCTTATTGTACTTGCTCTAAAGAGGACGGATGGATGCGAAGAGAGAGAGAGATAGACGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCT
dot-bracket secondary structure
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TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGGCTACGTCTGATAAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTGCTGGCTATAAGCATCTTTATAGCTCATCT
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SIMILARITIES| miRBase hvu-MIR156: 2e-39 PMRD osa-miR156f: 0.00000002 microPC miR156: 0.000001 | UniProt no hits RFAM mir-156: 0.000002 |
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