ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare subsp. Vulgare
source: PMRD, original name: hvv-miR156d
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGAGAGCAC miRNA* GTTTTGATTTCCCTCGTGCC mismatches: 7 bulges: 2 |
pre-miRNA
TGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTAGAGTCACTAACTTCCGTGAACCATTCTCCTTGAGAAGTTGTGGTACTGGAAAAACCGGTCCCTCCTAGTGAACCT
TGAAGGAAAATATCACCCGAAGAAGGATTCTCCTAGTTGTTTGACCACGGATGATGATGATGAAGTGACTTTCCCGGAGCTGTGTTTTGATTTCCCTCGT
GCC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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TGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTAGAGTCACTAACTTCCGTGAACCATTCTCCTTGAGAAGTTGTGGTACTGGAAAAACCGGTCCCTCCTAGTGAACCT
TGAAGGAAAATATCACCCGAAGAAGGATTCTCCTAGTTGTTTGACCACGGATGATGATGATGAAGTGACTTTCCCGGAGCTGTGTTTTGATTTCCCTCGT
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SIMILARITIES| miRBase far-MIR529: 0.0000002 PMRD sof-miR156c: 0.0000000007 microPC miR157: 0.0002 | UniProt no hits RFAM no hits |
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