ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare subsp. Vulgare
miRNA family: MIR160
source: PMRD, original name: hvv-miR160a
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA miRNA* mismatches: 11 bulges: 339 |
pre-miRNA
CGGCACGAGGCCCAAGCTCTCTCCAGTCTCTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCACCCACACGCCCACCAACACCTACCATTACCAAGCTCTCTCTCTCGATCT
TGGCACCTCTCTCTCCGCGACTCCATGAGTAGGTAGCGTCATCCATCCGTTCATCCATAAACACAATGTGGATGGAGCGTTTTGAGGTCAGCATTGCGAG
GGGGGCTCGTTTGTGAGTGTGGAGGTGGATGCATGGCTGACGCCGTGCGTGCAATGCAGCTTCTGGGTGTGGGGAGGTAGGTGAAGTGAAGGTTCGGCAG
GAAGAGGTGAAAACAATGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR160: 8e-17 PMRD tae-miR160: 8e-17 microPC miR160: 0.0003 | UniProt no hits RFAM mir-160: 0.00008 |
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