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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST055582
species: Medicago truncatula
miRNA family: MIRf469
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 CCTGTAATCCCAACACTTTGA

miRNA*
 AAAGTGCTGGAATTTCAGGTG

mismatches: 4
bulges: 0
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pre-miRNA
 TTCACTCTTATTACCCAGGCTAGAGTCCAATGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCAGCCTCCCAAGT
AGCTGGGATTACAGGCACTCGCCACCACACCCAGCTATTTTTTTGTATTTTTANTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCT
GACGTCAGGCGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTTCAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTGTTTCTTTGTGTTTTAATCAAATGACT
TTACATCTCCAANATGATTAAAACAAATTTTTTGAAAACAGCAGAAGGGCGGGGCACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAACACTTTGAGAGGCTGAGGC
AAGAGGATTACTTGTGGCAAGGGGCTGGAGACCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCCGTCTCTACTAAAAATAAAAAAAGATTAGCCAGGCATGGTGAC
GCATCTTTGTAGCCCTTGCTACTTAAGAGGCTGAAGTGGAAGGANTACTTGAACCAAGGAGTTCAAGGCTGCAGTGAGCTATGACTGCATCACTGCACTC
CAGCCCGGGGGACANANT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase hsa-mir-5096: 0.000000000000009

PMRD ptc-miRf12524-akr: 0.0000000000006

microPC no hits		UniProt sp|Q8N2A0|CX062_HUMAN: 3e-18

RFAM Metazoa_SRP: 3e-64		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
Source sequences
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