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Species belonging to selected taxon:

Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Zea mays, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008470
species: Sorghum bicolor
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 GCTTAAAAGATTCGTCTCGCA

miRNA*
 CGAGACGTATCTTTTAAACCT

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 TTGGCAAAATGAATACCGTAGCACTTTCGTTTATATTTGACAAATATTGTTCCAATCATGGTCTATATAGGCTTAAAAGATTCGTCTCGCAAATTACCGG
GAACTGTGTAATTAGTTATTTTTTATCTATATTTAATGCTCTATGCATATCCCGCAAGATTCGATGTGATGGGTAATTAAAAAATTGCAAAAGTTTTTGG
GAGCTAAACAAGGTCTTAGTTCTCAAAAATTTTCTTTTCGTCTCGTCACATCGAATCTTTGGACGCATATATGAGCATTAATTATAGATAAAAAAAATAG
GTAATTACATAATTTACATATAATTTACGAGACGTATCTTTTAAACCTAATTAGTCCACAGTTGAACACTACTTGCCAAATAAAATAAAAATGTTAGAGT
AGCTAAATCCAAAAA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124b: 0.0000000004

PMRD osa-miR442: 0.000000001

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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