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Species belonging to selected taxon:

Carthamus tinctorius, Centaurea maculosa, Centaurea solstitialis



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002948
species: Centaurea solstitialis
miRNA family: MIR172
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Centaurea solstitialis Centaurea Centaureinae Cardueae Carduoideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GAAATCTTGTTGATGCTGCCA

miRNA*
TTAGTATCATTATTTTCTG

mismatches: 3
bulges: 2

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pre-miRNA
AAGTTTTAAGTTATTGAACTTTCCATTGAGCATTTTATCTTTGTAAACCAGAAATCTTGTTGATGCTGCCAATATTGCTGCTTTGGCTGCTCTGTCTACA
TTCAGGAGGCCTGAATGTACATTTGGAGGAGAAGATGGTCAAGAAGTTATAGTAAATCCACCGGATGTGAGCTTCCTCTGCTTCCTTAATCCTTACTAAC
AAAGTCTTGGTGTTGGTTGATGTGATAGTCGACATTAATCTGCCTTTCTCATTGCCGTTGCCCCTTACTTAGGCCTGTCGTGAAACTGAAATATCACAAG
CTTTTGAAATATCACCTGGTTAGTGAAGCTATATAGTGTGGTACCAAAAGCTTTTGTGGAACCTACGGTTTTTGAATGTTTGAATATATTCATCTGATGA
TCCCCTTTGTAGCACAGTAGCACCCCAAGCTCTAAGCTGCAGTCTGGCCTAATAACCTCAAAATCAACTTAAATCCATGGTGGAAGTTACTGGTATCCCA
TAATTTTGAGCTTTTAAGGTCCTTATAGATCTACTTTCTATCCATGTGGGACAGGTTGTTAAACTTTTTGAATTTCGAAAAGACCTGTGGAGCCTTTCTG
TAGTCGGTTTGAATTTCATTTTTCAAATTCAATAAATTTGAATTCAGCATATGTACTGTTAGACTATCCTTGTGATAGCAATGTAATAAATTGTTCTTTT
TTTTCTTTCTGAAAGACAAAGTAACCTGTGTTAGTATCATTATTTTCTGTCTAAGGTTATTGATTGTGGTCAGTAGGAGGTCAGTCTTTAAT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
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MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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