miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Species belonging to selected taxon:

Euphorbia esula



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000604
species: Euphorbia esula
miRNA family: MIR169
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Euphorbia esula Euphorbia Euphorbieae Euphorbioideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TAGCCAAGGATGACTTGCCCG

miRNA*
 GGCAGTCTCCTTGGCTACT

mismatches: 0
bulges: 2
View larger
pre-miRNA
 TATATTCAAGAGGGAAAAGAGGAGTGACATGAAGATAAGAGTCTTGTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTTCACTATCTATAAGGTTTCAATAATA
CTGATAATACATAATCACACATCTACACTTATCGCTTCAATTTTACTTTTTTACAACCCTAAATTTAACCTCGACTTAGACCCTATTCTTTTTTTACTTA
TATTCAGCCAATAATTCGGTTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTCAGTTCAGTTCAGATCAGCTTAGTTTTTTTCAAAAAAAAAAAAAACAGGGCCTCAGCAC
AAAACTAAAGTTTTTGCAACTTTTCTGATTTGCCAATTCTAAAGTTGACATAATATTAGGTCTTGTTTTTATGACTGAAAAAAAAAACTATTAAACTGAA
GTGTATTTACTGAAGTGAAATTACTGAAAATTACTAATAACAAAGCCGTAGTCAAATTTTTATTTATATATTTCATTCCATATGCTGGAGGTTCAAAATT
TCATCTATATATTTCATTCCATATGCTGGAGGTTCAAATTTTCATCTATATATTTCATTCCATATATTTCATGTTTTATTCGGATATGGGATCGGGCAGT
CTCCTTGGCTACTCAGACAGACTCTCTTCTTCATGCCAGTCTTTCATTTCCATAAATCCAG

dot-bracket secondary structure
............(((((.(((((.((.((((((((..(((((((.(((((.((((((((((.((((.(((((.(((..(((((..(((((..........
.((((((.....................))))))..........)))))((((......)))).(.((((..((..((...........((((..(((..
..((((((..(((.((((((.((.(((((((((((((((((...(((((((..((...((((.((((((((........)))))))).)))).)).(.((
((.(((.((..((.(((((((((...((.((...)).)).))))))).)).))..)).))).)))).)....)))))))..))))))..)))))))))))
.)).....))))))(((((((...((((((((((((............))))..)))))))).......)))))))....))))))))))))..))))..
.........))..))..((((.....)))))))).)(((...(((..((((((........))))))...)))....))).)))))..))).))))))))
)))))))))))..))))))))))))..)))))))).)).)))))..)))))..........


SIMILARITIES
miRBase ghb-MIR169a: 0.00000000004

PMRD ghb-miR169a: 0.00000000004

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM MIR169_5: 0.0000000002		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;