ABOUT THIS RECORDspecies: Medicago truncatula
miRNA family: MIR838
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCTTCTTCTTCTTCTTGCACC miRNA* TGCTAAGAAAAGAGAAGAAACGG mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
CAACATCTTTATCTTCTTCTTCTTCTTGCACCCCCAAACTATCACTTTTCACACCCCTATATGTTTCATCATCATCACTACACGTTGGATGAACACGGGC
CCCAACAATATCATCACAGCAACCACAGGTACAACGACGCTTCGCCGGAAACATAGTTTCCGCTGACGCTTGAATCCTTCTCCGATGATGCTGCTTCCTC
TTCCTCAACGCTCGGATACAAAGAGTAGCCGGAACTTTATAAATCGCTAGATAAACGATATTCGCCACCGCACATGGAGCACAACAACAAACCGCCGCTG
TTCCACCAACCGCTTCACCGAGGCGCGTACCGGCTTTTAAAGAACTCTTGTTCTGTTGTAGTAGCGGTTGTCGTCGGTTTGACGATTGGACTTGTCTAAG
AACAACCTTACTCGACATATTGGATACTAATCTCTCGAGTCAGACAGAGACTAATTTCTCGAGTCAGATAAATTGTTTGTTTGTGCTAAGAAAAGAGAAG
AAACGGAGATA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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degradome data
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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