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Species belonging to selected taxon:
Sorghum bicolor
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST008496
species:
Sorghum bicolor
miRNA family:
MIR1875
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor
Sorghum
Andropogoneae
Panicoideae
PACCAD clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ACAATGGAGTGAGGTGCAACG
miRNA*
TTGCACCTTGCTCCATTGTGG
mismatches:
2
bulges:
0
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pre-miRNA
GGCCTTGTTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGTCCCCTGCAGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACTGCGATGTTCATTTCCA
TTGCACCTTGCTCCATTG
TGG
TATTGATGTTCTGCAGAAGCGAGTCCCTGTATCAAATAACTGTTGCAAGGTTGTTGGCATCGTCCATTGCCACACATGATACTATGCCACTAGCAGT
CGTCAGCTTCAACTGTGTGTTGTCGTATTGCATACACGGGTAGTAGGTGCATCAGCATTATAGCAGTTATTTGATACAGGAACTCTCCACTGTAGAAGTA
CAAACCC
ACAATGGAGTGAGGTGCAACG
CAATGAACAATATGGTAGCAGAGTGAAAGTCTGTGGAATTGCCGGGGGCAAAGTGAAATTTATCCGACTATT
TATTTGT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
osa-MIR1875
:
0.00000000002
PMRD
osa-miR1875
:
0.00000000002
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no hits
UniProt
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