ABOUT THIS RECORDspecies: Sorghum bicolor
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTCAAAAGATTCGTCTCGTGA miRNA* GCGAGACAAATATTTTGAGTC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
ACTTATAATTTGCGAGACAAATATTTTGAGTCTATTTGTGACATACAAACGAACAATGTTTATTTTATAAAATTTTTTAGAACTAATTATACTTCTAAGC
ATGAACAACTACATGATGATACCGAGAAACCTAGGCCTTGTTTAGTTCCAAAATTTTTTGCAAAATCGACACTGTAGCACTTTTGTTTGTACTTGACAAA
TATTGTCCAACCATGGACTAACTAGGACTCAAAAGATTCGTCTCGTGATTTACAGC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124a: 0.00001 PMRD osa-miRf12089-akr: 0.00005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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