ABOUT THIS RECORDspecies: Sorghum bicolor
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATAAGTTTGACTTAGGACAAA miRNA* TGTCCCAAGTCAAACCTCTCT mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCAAGTTATAGTTTACTACTTCACTTTAGCTTTGTCCCAAGTCAAACCTCTCTAACTTTTATCAAGTTTATAGAAAAATGCACCAACATCTAGAATATCA
AACTAGTTCCATTAAATTCTCCATGAAATATATTTTGATAATGCATTTATTGAACTTGTAGATGATAATATATTATTTTCTAAAAAATTGATCAAAGTTA
GATAAGTTTGACTTAGGACAAAGCTAATGTGAACAATAGTTTGAAACGGCG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase ssp-MIR437a: 1e-82 PMRD sof-miR437: 8e-41 microPC miR437: 1e-82 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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