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Species belonging to selected taxon:

Medicago sativa, Trifolium pratense, Medicago truncatula



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008371
species: Medicago truncatula
miRNA family: MIR1525
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT

miRNA*
 CATTTACTTAATTTACTCTTT

mismatches: 4
bulges: 0
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pre-miRNA
 AACAAGCCCTTAGGGTTAATTAAGTTTGTAGTCCCTAAAAATATTTACAATTTTGTTTGTAGTCCCTACAAAATAAAATCGTACTTTTTAGTTCCTGTGA
CATTTTCCTTAAGCATTTTAGGGACCAAAAATGTTGATGAAAATTTTTGACAGGGACTAAAAATTCAGATGGAAAAATTTTATAGGGACTAAAAATGTTG
ATGAAAAATTGTATAGAAACTAAAAACTGTGATTTTATTTTGTAGGGACTAAAAACAAAATTCTGAATATTAATAGGGACCATTTACTTAATTTACTCTT
TAATTTATT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase gma-MIR1525: 7e-51

PMRD gma-miR1525: 7e-51

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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