ABOUT THIS RECORDspecies: Medicago truncatula
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTTCCTTTAGTCCAAATA mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGATGTTAGGGTTTAAAGGGGTGGAGCTTCCTTTAGTCCAAATATGGATCTTGCTATGTTGATAGAGCTGCTTAGCTATGGGTCCCTCAACTCTACCCAT
CTTGTTCTTTGTGGTAGTTTTGTGGCTTCCATATCTAGGGAGCCTTATCACCTTTAGTTTAATCTTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTGCTCT
CTTACTTTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase mtr-MIR159a: 4e-101 PMRD mtr-miR159a: 3e-92 microPC miR159: 3e-92 | UniProt no hits RFAM MIR159: 0.00000001 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045638) |
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