ABOUT THIS RECORDspecies: Euphorbia esula
miRNA family: miR169l
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Euphorbia esula Euphorbia Euphorbieae Euphorbioideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGCAGTCTCCTTGGCTATGCT miRNA* GGTAGCCAAGGATGACTTGCCCG mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
GTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCC
TAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATT
ATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGG
CTCCATCTCTTCT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR169v: 0.00000000007 PMRD ptc-miR169v: 0.00000000007 microPC miR169: 0.0003 | UniProt no hits RFAM MIR169_5: 0.00000000008 | most similar mature miRNAs |
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