mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTTCCTAAATATAAGAC CTTATATTTAAGAATGGAGAG ACCGAATTGCATGTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGACCTTTTAAAGATTTTACTAGGAGACTACATAAGGAACAAAATGAGTGAATCTATATTTTAAAATATGTCTATATACATCCCTATGTAGTTCATAATACAATGTCTAAAAGGTCTTATATTTAAGAATGGAGAGAGTACATCTCA CTCCGATTACAGCTGTTGTGGCACTGCCCAACTTGCATGGCATGTACTGTAGAAAGTAGCAGCACATGCAATGAATAAGAAAAGGTATGAGTTGTATCAATTGGAATAATTCTTCAACCGAATTGCATGTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGACCTTTTAAAGATTTTACTAGGAGACTACATAAGGAACAAAATGAGTGAATCTATATTTTAAAATATGTCTATATACATCCCTATGTAGTTCATAATACAATGTCTAAAAGGTCTTATATTTAAGAATGGAGAGAGTACATCTCA 1 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 2e-47 tae-MIR1122 0.00000000000004 -53.4 ..........((((((((.((((((((.(((((((((((((((((..((((..((.((...(((((((((.(((.((...)).(((.((.((((((....))))))...)).))).))).)))))))))..)).))....))))))))))))))))))))).)))))))).)))))))).... (-53.4)