mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCTGTCCCAAAATAAGT TTATTCTGGGACGAAGAGAGT TTTCATCTAACTCCCTCTGTCCCAAAATAAGTGTCACTGATCTATTATAAATTTTGTACTAATTTAATACTAAATCTGCGACACTTATTCTGGGACGAAGAGAGTATAATGTT GAAATGAAGCATGCTGTGGGGAGGATCTAATAAAAATTGATCTAAAATAAAGAAAGAGCAATCTTTGGATGACAATGAGATTCATGATGGAGACTCAATGCAGATTGTCTTTCCTTTCCATTTGTTTCTTATTCTTTTCATCTAACTCCCTCTGTCCCAAAATAAGTGTCACTGATCTATTATAAATTTTGTACTAATTTAATACTAAATCTGCGACACTTATTCTGGGACGAAGAGAGTATAATGTTTTGTGCTGAGTTAGGTGGAAGGTCGAGACGACCTCACCTACATAAATGTTCCTTTGTTCTACTCCCTCTGTTCCTAAATATTTGTCTTTTTAAAGATTCAACTATGGACTACATACGGAACAAAATGAGTGAACTTACACTCTGAATTATGTCTATATATATATCCATATGTAGCCCATAGGGAAATCTCTAAAAAAACAAATATTTAGGAACGGAGGGAGTATTTATTAATGTATGGATGCTTACCGACCCTAAATATATTTGGTTAAAATGTTTCCCTATGAAGTTTCTATACTAT 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 7e-18 osa-MIR1862d 0.00009 -32.7 .........((((.((.(((((((.((((((((((...(((.((.((((((((.......))))).))).)).)))...)))))))))).))))))).)).))))........ (-32.7)