mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAGTTTATAGAAAAA TTTCCCTATAAACTTGGTCAAAG AAGATTTTTCCAAAGTTAAACTTTGTAAACATTGACCAAGTTTATAGAAAAAATTATCAAATTTACAATACCAAATCAATACCATTGGAATCATCATGAAATACATTTTCATATGATATATATTCGGTATTTTTTTCCCTATAAACTTGGTCAAAGTTTACAAAGTTTGAC GTGTGCATGTAGGTGGGTGGCCATTGCGGTGGGACTTAGCGCACATTTGCACTTGACTGAGCTTGAGCTTGACATTGGACGATGAGGTTGACGCATTACTTACACTTAGTGAATCGGTGGCACAAACAAAACAGATACAAGTGCTTGATCAAAGCCTAAACGAACAGAAGAGACGAAACATTGTGCACATTTTTGGGAGTTTAGGAAAACATTGTGTATTTGTGTAGTAGAAATTAGATTAAGTGCGAACTTGAAGTGCTCAATAAGAATATTTTTTTGGTGCCTTTTAGCCTTGTCCAAACAGAGATTTAATCATATAGATCATATAGGATAAGTTAAATGGCTGGTATTAACTGCTAATGCCAATAAAAGCTACTCCATCCATCCAAGTTTATTAGGCCCCATTTGGAAATCTCTGGCACTAACGCAAAGAATGCACATTTTGGAGTAGTTTCTGATTTTTTGCTTTGGCCGACAGATTTAGGACCTGAGAGAATTGAAATTAATGCAGATTTGAAATGGCTGGCACGCCGTTAATGCATATTTGGAACCCGGGAGACTTGCAATTAAGTGAGACACGGTTTAAGAGCGAGGATTGGCAAGTGGCCTTATAATCTCGAAATACCCAGATTTGGAATGTGACCTAATAAATTTGGATGGCGGGAGTAGCTAATATCATATTCCCTCCTTGCCAAATTATAGTGCATATAAGATTTTTCCAAAGTTAAACTTTGTAAACATTGACCAAGTTTATAGAAAAAATTATCAAATTTACAATACCAAATCAATACCATTGGAATCATCATGAAATACATTTTCATATGATATATATTCGGTATTTTTTTCCCTATAAACTTGGTCAAAGTTTACAAAGTTTGAC 0 2 5' arm Leymus_cinereus_x_Leymus_triticoides mirnest 100 sbi-MIR437l 0.00000004 -51.3 ..............((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((.(((.((.....((((..........)))).(((((.((((((.....))))))))))).)).))).)))).)))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))) (-51.3)