mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAACTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCTATCCAGAGTTTCA ATTAATAAGGTAGAATCTGTTAAACTCAGGAGGGATAGCGCCACATATAACACAATTCATTCGTATTGGCGCTATCTATCCAGAGTTTCACGGCTTCTTCTTACTTTA ATCAAAGTGACTAGCACCTACTCTCTCTCCCTCTCTCTTCAACCTTTATGCATGTGTGTGTTTTCTTCCTCAGGGGTTTGATTCTTATGGCATACACATATATGTTCCTCAAATATTGGCCTGTATTGTTGCATATTAATAAGGTAGAATCTGTTAAACTCAGGAGGGATAGCGCCACATATAACACAATTCATTCGTATTGGCGCTATCTATCCAGAGTTTCACGGCTTCTTCTTACTTTAAGATATCATTCTCTTATGACATACATGTTCTAGCTAGTACCTAGAAATTAAAATGAACCACCCCATTTTAATTTACTTCCCTTTCTCTTTTTTTCTGTTTTCATTTATTATACTTTACTATGATTATTCTGTCTGAAACTAGGATCAAAATCTTGATGATGATGATGATGACGATGAACGA 2 0 5' arm Arachis_ipaensis mirnest MIR390 0.00000002 vvi-MIR390 0.000000005 -40.2 .....(((((.((((.((((.((((((.(((.(((((((((((.((((..............))))))))))))))).))).)))))).)))).)))))))))..... (-40.2)