mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCGGTTCAATAAAGCTGTGG CAGCTTTCTTGAACTGCATC ATCAATACATATGGTCCTCTTTGTATTCTTCCTCAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCCCTAATTTTTTTATCTTTTGTTTTTCCTCTCTCAGATCCAATTTTTTCTTTGGTAAATACTTATAATTTATCAAAAAAAAAAAAAGATGGATTTTTGGGAATTGAAAGATGGAAAATTTTAATTTGTGGGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAATAGGCCCAACAAAAATTCA CTCTTTCTCTCTCTACTTTTTTTTTCTCTGTTTCTCTCTCTACCCCTAACTAGGGTTTAGCCCCTTCCTTAGGTCGGGCCAAATACCTAATAGATACACATACATACCCAATCAAATCAAAATCCAAATTATCAATACATATGGTCCTCTTTGTATTCTTCCTCAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCCCTAATTTTTTTATCTTTTGTTTTTCCTCTCTCAGATCCAATTTTTTCTTTGGTAAATACTTATAATTTATCAAAAAAAAAAAAAGATGGATTTTTGGGAATTGAAAGATGGAAAATTTTAATTTGTGGGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAATAGGCCCAACAAAAATTCAAGATCCGCCCTTTTTTTTTGCTGATCGATGATGGCTCTCTTCTTCTATTATGGTTCCTAAGTCCATCTTTTTTTCAATATATTTTTATCTTTTTGATCGCTATTTATTTAGATTTATCTTTTTTTTTTTCACGTCTTTTTATTTTTCTTACCTCATCTTTGTGGGTCTAACCCTAGTGTCCATAAGGGAAAGGGAA 1 1 3' arm Mesembryanthemum_crystallinum mirnest MIR396 0.00000000006 lja-MIR396 0.0000000000008 -77.8 ...........(((.(((.(((((((.(((((((((((((.((((((((((....(((.((.((((((((((((((...(((((.....(((((((.((((((.((((((((((.......)))))))))).)))))).....)))))))..))))).)))))))))))))).))........))).)))))))))).))))))).))))))))))))).))).)))........... (-77.8)