mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAGGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTCCCTGGCTACA GAAGAAATAGAGAGTGGATTGCAGCCAGGGATGACTTGCCGAGTATTTCTTTGTTTTAATTGCCTGTGGTTTACCAGGGATTTTATATCGGCAAGTTGTCCCTGGCTACATTTCTCATGCAAGCCTCT AAAACTGAATAACAGAAAATTAAATTCTACTTTCTTTGTCGAAGAGAATTTACATGAAGAAATAGAGAGTGGATTGCAGCCAGGGATGACTTGCCGAGTATTTCTTTGTTTTAATTGCCTGTGGTTTACCAGGGATTTTATATCGGCAAGTTGTCCCTGGCTACATTTCTCATGCAAGCCTCTTGAGACCTAATAAGTATTTTTATTTTTTTATTTTTCATCTGACATTCAGCACCCGTATGAAAATTCAAATAAATTCGAATTTGTGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGG 1 0 5' arm Nicotiana_benthamiana mirnest MIR169_2 0.000007 vvi-MIR169s 0.0000004 -47.2 .........(((((.....((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((...((((......)))).)).)))))...))).)))))))))))))))))))).)).)))))............ (-47.2)