mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTTCGTTCCAAATT TTTGGAACGGAGGAAGTAGCT AAACCACGCCAATACTCCCTTCGTTCCAAATTATAAGTCACAAAGAGTCTTGGAGAGTCAGTTTTTTTAATTTGACTAAATTTATATAACAAAATAATAACATTTATGATACCAATTAAGTATTATTAGATTCTTTGTTAGCTATATTTTCATAGTATACCTATTTGATGTCATAAATTTTTGCGTTTCTATTTATAATTTTAGTCAAACTTTGAGATGGTTTGACTCTCCAAAATTCTTGGAATTACTTATAATTTGGAACGGAGGAAGTAGCTCCTTGCGC GGAAAAGGCGGAACGAAATGGACCATTTCTTTTCAATTTTGTTAGCTCAATCTGCGCTCAGGTTCATAAATCAAAATGTACAAACGCGTCTCCTGTATGTTCAATTTTGCTCCAGACTCTTTTGAGTCTTGAACAACAAAATTGCTGCCATTCAAATTGGTGCAGACAGCTCTTCACGCCTTTGACCACCCCATAACAAGTTTCTCCTGTGACCCGTGGGCACCAAAACCACGCCAATACTCCCTTCGTTCCAAATTATAAGTCACAAAGAGTCTTGGAGAGTCAGTTTTTTTAATTTGACTAAATTTATATAACAAAATAATAACATTTATGATACCAATTAAGTATTATTAGATTCTTTGTTAGCTATATTTTCATAGTATACCTATTTGATGTCATAAATTTTTGCGTTTCTATTTATAATTTTAGTCAAACTTTGAGATGGTTTGACTCTCCAAAATTCTTGGAATTACTTATAATTTGGAACGGAGGAAGTAGCTCCTTGCGCCTTTTCACCGTGAAATAGATATCTGCTATAGATGTGTTCGGTCAAAAATAAAGTAAATAAAAATAGTATAGAAGAAAGGCAGCACATTTACATGAGGCCCAGAGAACTCATGTGGTAAAAGTGAAAACAGTGAAACAAAGTGCACATTTTCCATAACGATTTGGCAAACATTAGACTCCTAAAAAACCCAAATTATCAGTTATTGGGTTTTGAAGAAGATTTAGACTCACTTT 2 0 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR1122 0.00000002 osa-MIR819b 0.001 -83.5 ......(((...((((.(((((((((((((((((((((....((((((.((((((((((((...((((((((((((((((.(((((.....((((...((.((((((((((.(((.((.((((.................(((((......))))))))).)).))).)))))))))).))...)))).....))))).))))))))))..))))))....)))))))))))).))))))......))))))))))))))))))))).)))).......))). (-83.5)