mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCATGCTGTAGTTTCATCT GTGAAGCTGCCAGCATGATCTG GTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTATTTTACCTCTCTCCCTGATTGCCAAGGACGAATTCAGAGATTCGGGGAGAGAGGAATAGGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGC GGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTATTTTACCTCTCTCCCTGATTGCCAAGGACGAATTCAGAGATTCGGGGAGAGAGGAATAGGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGAAAACCCTAGCTAGCAGAGAATTACATCCACGCATCAAATCGTCAGTGGATGTGTTCGGGTCAGTTCTTGCAGAGAATTCGTGCTGCAACGAGATCAGATATGGTGAGATACAGATCAGATATAGATGTATGGAGCAGATCCGCTCAAGTTTATTCTTTCGAGTGTTCTGCTAATTTCTTGTTTTGCGCTTTTGCTTCTCTCTTCCGTTCAGTTCTGCGGAGAGCGTGTTTGGAATTTTGGATCTCCATTGTAGATCTGTTCTAATTGTTTAATTTGCATCTTCCATATACTATTCCTTTTAGAGTTTTAGTTCTTCTAAGATCGAACAGAGGGATAAATTGATCATGTAGTAGTAGTACTACTAGCCCCTGAATCCTAGTGTTGTTAGCATGAAATTGCC 1 1 3' arm Panicum_virgatum mirnest MIR167_1 0.00000000001 sof-MIR167b 0.000000000000008 -65.8 ((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((..........(((((....((.(((((((((((((........((.....))......))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).))).)))))))) (-65.8)