mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAAGTTTGACTTAGGACAAA TTGTCTAAGTCAAGCTTCTAT AAATTATAGTTTAATTTAGCTTTTGTCTAAGTCAAGCTTCTATAAATTTGACCAATTGTATAGGAAAAACCAATATTTACAACATCCAATTAGTTTTGTTGAGTCGGCCATGAAATATGTTCTGAATTTCTGATAGTGCCTTTGTTTGGTACTATATATGTTAATATATTTTTCTAAAAAATATAGTTAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAGGACAAAGCTAAAGTGAACTATAATTTGGAATGAAGG AAATTATAGTTTAATTTAGCTTTTGTCTAAGTCAAGCTTCTATAAATTTGACCAATTGTATAGGAAAAACCAATATTTACAACATCCAATTAGTTTTGTTGAGTCGGCCATGAAATATGTTCTGAATTTCTGATAGTGCCTTTGTTTGGTACTATATATGTTAATATATTTTTCTAAAAAATATAGTTAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAGGACAAAGCTAAAGTGAACTATAATTTGGAATGAAGGGGTTATTAAGTTGCTGCCTTGCTATCTGAATAAGCACCCAGGTAATGTAACACCTGACTGCTTCATTAATCTTGTATTCCCATTTCATTTGATATGTTCTGTCGCAGCTGATGTAATTATAGTTAATTATAGTTATTTACAATATTGCTGATTCAATCTGTACCCCTGAACACTCCTTTTCCCAAGGTACCTACACAGTTCCACTGGTACACCTTCATAGCTTCTTGACCATTATATCTAGCAATTACTAATTGTAATTGAAAACTTAACACATTTTCATTTTGCCTCCATAGAACTTTTTGGCTGGTTGCTTACTAGGCAACACGGACTAATCACTAACATTAGATGTTTATTTAGTATGATGTTCTGTGGAGTCAATCTTGCTTTATTTTACAGATTCATTTGAATCATATTGATGCAGTGGTGCAACTGCGACCATCAATGTCACATGTAATTTCTGGTCGAGCATATAATAGGCAGGCTTTACAATCTCGGGAAATGAATGGTGGTGCTAGTGGTTCAAAAGGCTCCATCTCGTAAGGGAAGTGAGCGCCCA 2 0 3' arm Panicum_virgatum mirnest 100 osa-MIR437 0.0000000002 -64.4 (((((((((((((.(((((((((..((((((((((((((((.(((.((((((..(((...((((((((..(((((...((............))..))))).(((((....(((.....))).......)))))((((((.......)))))).(((((....)))))))))))))...)))...)))))).))).))))))))))))))))..))))))))).))))))))))))).......... (-64.4)