mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCT CACGTGCGCTCCTTCTCCATC GCCAATCTAGCTCATCTAGCATTCCATTTTTGCTTCAGTTGTTCGCAGTGCCTCATGAGGAGGGGCGAGCAAACCCCTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCTTGGTCGATCGGCCGGCAGCCCGCTGCATGTGTGCATGGTCGATCGCAGCACGTGCGCTCCTTCTCCATCATGGATTCTCGCCCCGTCGATCCATCTCGGTTCGAACGCCCCCTAATAAGCTAATGGGTGGGAGAGCTAGCTCGATC GCCAATCTAGCTCATCTAGCATTCCATTTTTGCTTCAGTTGTTCGCAGTGCCTCATGAGGAGGGGCGAGCAAACCCCTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCTTGGTCGATCGGCCGGCAGCCCGCTGCATGTGTGCATGGTCGATCGCAGCACGTGCGCTCCTTCTCCATCATGGATTCTCGCCCCGTCGATCCATCTCGGTTCGAACGCCCCCTAATAAGCTAATGGGTGGGAGAGCTAGCTCGATCTCATCAGCCAGCGGCGGATCGACGGCGGATGCGTTGTTGGTAAGAAAACACAGCACACAGGTGCTCCATTTCTTGGTTAGGCAGGAATTCTTAGATGAGATGAGAGTAGCTGGAAACTAAAGGTTGGTGGTGGTCAGTGGCAAGGTCATAGATGGTGCTCGACGAATCCTTGACTTAGACATTTGTCATTGGAGCTCGTTGAAACTTCCATGAAATCTTTAATTCTTGTGTGGTCGCAATCTTTTTTCGCTAGTAGGTTGTCCAAAGTAACACTAAGACGCATCGATTTGAACTGCTTCACCTGAAATTGCCAAGTGGCGCCGTATTATATGACCATTCTCCTGTAGAATTAAAGTTGAATTCCTGGTCTCTGCGATTAGGCACCTTTTTTCAGCTTTGCATAAAGAAATGGTTATTTTTCTACAGAAAGCTGTCATTACAAGATTCTTTTTAAGGAACTACACAAATTTTCAGTCTACCCCAATGTAAGGTTCACTCGGTGGCC 2 0 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR164 0.000001 sbi-MIR164b 0.000000000003 -94.3 ......(((((((.(((.....((((((...((((.((.((((((....(((..(((.((.((((((((..((.((.((.((((((((.((.(((((((((..(.((((((((((...((.(((.....))).)).)))))))))))))))))))).)).)))))))).)).)).)))))))))).))....)))...))).))))))....))...)))).))))))..))))))))))....... (-94.3)