mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCATCATCATCATCATCGTCA ATGATGATGATGGTGATGATG ACGATCCACTACTTGTTGCTCCTGTTTTCGGCGGTCACCCTCCATCATCATCATCATCGTCATTCTAGGTGCTTGTTCGACGACTTCCTTGTCTTTGTCGATCCCATGAGCCTCATCGCAAATTAGAGTTTGTCGATCATCATCTCCATCTCCATTTCCATCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCATCATTCTTTTCTTCATCACGCGTTAACTTGTTATTCTTTGCCGTGTCTTCAAGAGAACTGACAGCTTCTCGATTAACGCTCCCACTGCTGTTACTGCAGTTGCTCCACGATGCAGATGATAATGTTGATATTAATGATGATGATGATGGTGATGATGATGCTGGGAGTAAGAGGCATCAGGCCAGTGGGAGGGAA GGGTGTTTGTCTTTGGACTCTTTTTCTCTTTCAAGTTTGTCCCTCATTTTAGCCGCGAGTGCTTCCGCGATGGTTTTCTCGAGAGTAGCAGCAGCAATGGCTCTCTCTTGTTTCTCTTTGTCAATTCTCTCTCTATCCTGTTCCAACGTCATCATTCGTTCGTAATTTTTGTCTTTATCTTTATGCAGTTGTTCCGCTATCGGGTTTTCCGTTTCCGTTTCCTTATCACGATCCACTACTTGTTGCTCCTGTTTTCGGCGGTCACCCTCCATCATCATCATCATCGTCATTCTAGGTGCTTGTTCGACGACTTCCTTGTCTTTGTCGATCCCATGAGCCTCATCGCAAATTAGAGTTTGTCGATCATCATCTCCATCTCCATTTCCATCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCATCATTCTTTTCTTCATCACGCGTTAACTTGTTATTCTTTGCCGTGTCTTCAAGAGAACTGACAGCTTCTCGATTAACGCTCCCACTGCTGTTACTGCAGTTGCTCCACGATGCAGATGATAATGTTGATATTAATGATGATGATGATGGTGATGATGATGCTGGGAGTAAGAGGCATCAGGCCAGTGGGAGGGAATAGTGGCTGTATTAGATCCTGATGAAGAGGTCGACGATGACGAAAGAAAGGATGTTTTTGCAGTGGGGATCGGCCTCATCGATCAGTTCTGCGGCACTGTGGAAAGCTAGAAGTATCTGCCTTCTTGCAGCGCA 1 0 5' arm Avena_barbata mirnest mir-598 0.0004 100 -88.6 ....((((((.((((.((((.((.(((((((((.(((.....((((((((((((((((((((((..(((((..((.(((((((.(((..((..((((.((((............)))))))).))))).))))))).)).)))))..(((..((((.........................(((((.(((((((......((((((.(((....))).....)).)))).....))))))).(((((((.....((.......)).....))))))).((((............))))))))).))))..)))...)))))))))))))))))))))).))))))))))))..)).)))).))))..))))))...... (-88.6)