mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTC GGAATGAAGACTGATCCAAGA TAGAAGAAAAATAAAGTGTTTGGAATGAAGACTGATCCAAGATCCTCCTTTCTTTTTTCTTTTTGTCTCTTCTTCTTTTCTTATAACCTTTTTTTCTTTTAAGTACATTTCTCTTCTCTACTCTTGTGTATTTCTTCTTCTAGGGTCTCTTTGCTTATTGGTTGAAAGTTATAATCTAAGTTCAAGAGATATTATGGAACGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCACACCCATTTTTCAGCAG ATTTGAATTATGATAGTATGATCATTTCATAGAAGAAAAATAAAGTGTTTGGAATGAAGACTGATCCAAGATCCTCCTTTCTTTTTTCTTTTTGTCTCTTCTTCTTTTCTTATAACCTTTTTTTCTTTTAAGTACATTTCTCTTCTCTACTCTTGTGTATTTCTTCTTCTAGGGTCTCTTTGCTTATTGGTTGAAAGTTATAATCTAAGTTCAAGAGATATTATGGAACGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCACACCCATTTTTCAGCAGCTCAAGAAAAAAAGATATGTACTTCTCTTCTTCAAGTAGTTAGTACTATTAAAGTTGGAATAATCTTTTTCTATTATTATCGTTGTACATTTAATTTCTATTGACCTTTGTTTTGCAAAATTACTTACTTTTTGTAACAAACACATCAACATGACCGAAATCAACTCAATGGTGATGAAGAA 5 0 3' arm Petunia_axillaris_subsp._axillaris mirnest mir-166 0.00000002 osa-MIR166g 0.0000000008 -53.1 .....(((((((...((((..(((((((((.(((.(((.(((((.(((...............((((((((...(((...(((((((.((((..((...((((((..........(((((....................)))))......))))))..))..)))))))))))...)))...))))))))....)))..))))).))).))).)))))))))..))))..)))))))..... (-53.1)