mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTCCTACTCCTCCCATTCC AGTGGGAGCAGAGGATAAGACT TTGTGGATGGAAGTCTTGAGGAGTGGGAGCAGAGGATAAGACTGCTGCTTTGAATATTATCAGTCTTTCCTACTCCTCCCATTCCTATTGGCTTCACCACACA GGGGGTTCGTTGTGAGAAGGGAATGGATGTGTTTTGTGGATGGAAGTCTTGAGGAGTGGGAGCAGAGGATAAGACTGCTGCTTTGAATATTATCAGTCTTTCCTACTCCTCCCATTCCTATTGGCTTCACCACACATCCCTTCCCAACGCAAATTATTAAGATGAATATGGAGAACCAGTCATCGTGCTTTGTTCTGTGGGGGTTGTACAGGGATGCCATTTAGTTTTAAGGCCATTAGGTCTCGGAGAGCAGGGAAAAACCAGGCAGTAACTCATGATCCCATGTGATTTATGAACTCTTACAGTTTTCCCCACTCCACCGAGACCTATGGCCTTCACTACACATCCCTATTTTGTCTTCACTGTTACACTTCAGATCTGCTCGCATGGCCCAGGTGCTGTATTAGTTATGTTGAAGTTTCTTGAGATGCTGGTAAAACGAAAGCCATTATTCTGTCCCGGATTATTTATGGAGGGGACATGCGTCTGGGTGTGGAAGTATGGCCAAATCTAGAAAAGGAGCTATGACCATTCTGTCCCGGATTATTTATGGAGGGCGACATGCGTCTGGGTGTGGAGGTATGGCCAGATCTAGAAAAGGAGCTATGACCAGTTCTGTAGGAAACATTGAAGGGTACCTAAGTGGGAAGCTCAATTCATCTCATTTTCATCACACAATGAAGTGCAGTCAAGGCGTGTAAGGAACTTTGTGAAAAATAAAAATTTTGCAGTCGATCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 2 3' arm Picea_sitchensis mirnest 100 pab-MIR482c 9e-54 -44.5 .(((((...((((((...(((((((((((.((((((.(((((((.((..........)).))))))))))).)).)))))))))))...)))))).))))).. (-44.5)